我们的科学是由对周围世界的好奇心驱动的. 我们以从物理、数学到生物物理学的各个科学领域的实验和理论进展为指导. 我们天生具有合作精神和开放思想, 我们善待彼此, 感激之情, 和谦卑.
我们的探索、太阳城官网和原则
我们的追求
- 找出可以通过实验检验的问题;
- 识别具有基本意义且难以用已建立的理论和计算方法描述的生物系统;
- 发展新兴的理论和计算技术，适用于感兴趣的问题;
- 确定有助于电池技术创新的材料.
我们的太阳城官网
- 生物物理学(计算). 基于结构的(SMOG) v2的开发.4.2)模型和OpenSMOG，目的是通过高度优化的MD仿真包进行太阳城官网, 如gromac和OpenMM, 核糖体和其他较大的生物分子系统在水溶液中离子存在时的大尺度构象动力学.
- 化学生物学(计算). 在OpenMM环境下太阳城官网糖胺聚糖多糖构象动力学的计算方法的发展, haparan硫酸盐, 以及它们的合成类似物. 我们的工具包包括最先进的分子动力学模拟(显式和粗粒度)与采样技术, 统计力学, 量子chemsitry, 以及深度学习(AI)方法.
- 物理化学(理论). 低温液体动力学太阳城官网的重整化群和全息方法的发展.
- 材料化学(计算). 太阳城官网金属有机骨架(mof)中的电荷行为，以了解这些材料是否可以作为多价离子传输的有前途的固态介质. 我们的工具箱包括最先进的统计力学和量子化学方法.
我们的原则
我们的科学是由对周围世界的好奇心驱动的. 这与激情相结合, 长期愿景, 以从物理、数学到生物物理学的各个科学领域的实验和理论进展为指导. 我们天生具有协作性, 我们处理问题的方式是开明的, 重视任何学科的科学家, 善待彼此, 感激之情, 和谦卑. Docet Omnia. 不是后天习得的真理, 而是自由进行太阳城官网的想法”(莫里斯·梅洛-庞蒂), 法兰西学院)
资金
国家科学基金(合作)
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代码
我们开发了基于全原子结构的模型(SMOG)，将Manning反离子缩合理论推广到RNA和核开关，即显性二价(镁)但隐性单价离子. c++代码和文件可以在网上找到.
全原子结构模型，SMOG v2.4，和OpenSMOG (v1 . 1).1.0)都是开源的，可以在http:/smog-server上免费获得.org/smog2. OpenSMOG是一个python库，用于基于结构的模型的分子动力学(MD)模拟，可以通过pip或conda安装.