生物系
Peter Clote
Professor
Peter Clote
Ph.D.
Contact
Higgins Hall 577
Telephone: 617-552-1332
Email: peter.clote@pronewport.com
ORCID 0000-0003-3628-2874
Education
- Sc.B.他是麻省理工学院的教授
- Ph.D., Duke University
- 巴黎第七大学法学博士
Research Interests
计算生物学和生物信息学, synthetic biology, 结构与系统生物学, RNA molecular design, kinetics, RNA三级结构基序, 大分子结构, molecular evolution, 生物信息学中的机器学习(神经网络), 支持向量机).
Department
Research
RNA在许多生物过程中起着广泛的作用, 包括遗传密码的重新翻译(硒代半胱氨酸插入), 核糖体移码转录和翻译基因调控, 温度敏感的构象开关, 核糖体中特定核苷酸的化学修饰, 选择性剪接的调控, etc.).
我们实验室对这类问题很感兴趣, 特别是在发展新的基于热力学的算法，以更好地了解这种RNA的折叠和折叠动力学. 我们对合成核酶(核糖核酸酶)的计算设计感兴趣。, 合成核开关(通过变构调节基因的rna), 合成热酶(由温度变化触发的调节RNA)和其他RNA类别——对合成生物学有贡献, 纳米技术的“湿”模拟物, 一个可能在21世纪占据主导地位的领域.
Selected Publications
更多刊物可浏览 Dr. Clote's Website
- P. Clote, A. Bayegan. 使用蒙特卡罗和吉莱斯皮算法的RNA折叠动力学. 数学生物学报(2017)，arXiv文章ID 1707.03922.
- Bayegan AH and Clote P. "RNA折叠轨迹的IP算法，生物信息学算法研讨会(WABI 2017)， 2017年8月21日至23日，马萨诸塞州波士顿. WABI2017是第八届ACM- bcb 2017 (ACM生物信息学会议)的一部分, 计算生物学与健康信息学.
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